يعمل المعهد العالي للدراسات البحرية على تأهيل وتدريب ضباط السطح والمهندسين البحريين، للحصول على الشهادات البحرية المتخصصة، التي تؤهلهم للعمل على متن السفن، وفقا لمقتضيات ومتطلبات المنظمة البحرية الدولية، كما يعمل المعهد على مواكبة المخططات الاستراتيجية للنهوض بالقطاع الملاحي بالمغرب عبر الإرتقاء بمستوى التطوين المقدم للطلبة.